自然受孕过程中，胚胎需要在子宫内继续发育至囊胚阶段才能成功着床。同样，在试管婴儿技术中，让胚胎发育到囊胚阶段，可以提高移植成功率。此时的胚胎已经经历了初步的自然选择过程，只有那些能够顺利发育至此阶段的胚胎才有可能拥有较高的着床潜力。与早期胚胎相比，囊胚期细胞数量更多，结构更为复杂，这为科学家提供了更多的信息用于评估胚胎质量。
通过观察囊胚形态、生长速度及细胞排列情况等指标，医生可以更准确地挑选出具有较好发育潜能的胚胎进行移植，逻辑推演后提高妊娠率。第三代试管婴儿技术中的PGS技术能够在胚胎移植前对其染色体数目和结构进行全面检测，筛选出染色体正常的胚胎进行移植。这种做法不仅有助于避免遗传性疾病传递给下一代，共时性地也因为染色体正常与否直接影响着胚胎着床能力和后续妊娠发展，故而极大地提高了健康宝宝出生的概率。当胚胎发育至囊胚阶段时，其内部已经开始分化形成滋养层和内细胞团等结构，这使得囊胚与母体子宫内膜之间的同步性更强。
研究表明，囊胚期移植时子宫内膜的接受状态佳，有利于胚胎着床。